Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPRP00739 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPRP00739 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPRP00739 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPRP00739 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPRP00739 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPRP00739 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPRP00739 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPRP00739 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPRP00739 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPRP00739 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPRP00739 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HPRP00739 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPRP00739 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPRP00739 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPRP00739 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPRP00739 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPRP00739 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPRP00739 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPRP00739 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPRP00739 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPRP00739 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HPRP00739 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPRP00739 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPRP00739 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPRP00739 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HPRP00739 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPRP00739 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPRP00739 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPRP00739 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HPRP00739 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPRP00739 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPRP00739 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPRP00739 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPRP00739 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPRP00739 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPRP00739 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPRP00739 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPRP00739 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPRP00739 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HPRP00739 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPRP00739 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPRP00739 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPRP00739 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPRP00739 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPRP00739 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPRP00739 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPRP00739 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPRP00739 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPRP00739 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPRP00739 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPRP00739 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPRP00739 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPRP00739 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPRP00739 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPRP00739 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPRP00739 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPRP00739 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HPRP00739 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPRP00739 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPRP00739 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPRP00739 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPRP00739 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPRP00739 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPRP00739 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPRP00739 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPRP00739 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPRP00739 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPRP00739 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPRP00739 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPRP00739 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HPRP00739 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HPRP00739 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPRP00739 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms