Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGA10O75578 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA10O75578 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA10O75578 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms