Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACTN4O43707 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTN4O43707 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms