Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT7O43581 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT7O43581 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT7O43581 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT7O43581 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT7O43581 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT7O43581 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT7O43581 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT7O43581 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT7O43581 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT7O43581 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT7O43581 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT7O43581 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT7O43581 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYT7O43581 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT7O43581 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT7O43581 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT7O43581 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT7O43581 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYT7O43581 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT7O43581 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT7O43581 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT7O43581 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT7O43581 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT7O43581 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYT7O43581 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT7O43581 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT7O43581 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT7O43581 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYT7O43581 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYT7O43581 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYT7O43581 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYT7O43581 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYT7O43581 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYT7O43581 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYT7O43581 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYT7O43581 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT7O43581 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT7O43581 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT7O43581 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT7O43581 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT7O43581 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT7O43581 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT7O43581 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT7O43581 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT7O43581 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT7O43581 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYT7O43581 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT7O43581 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT7O43581 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT7O43581 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT7O43581 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT7O43581 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT7O43581 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT7O43581 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYT7O43581 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT7O43581 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT7O43581 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT7O43581 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT7O43581 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT7O43581 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYT7O43581 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms