Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNN4O15554 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNN4O15554 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms