Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F3O00716 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F3O00716 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F3O00716 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F3O00716 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F3O00716 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F3O00716 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F3O00716 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F3O00716 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F3O00716 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F3O00716 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F3O00716 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F3O00716 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F3O00716 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F3O00716 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F3O00716 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F3O00716 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F3O00716 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F3O00716 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F3O00716 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F3O00716 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F3O00716 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F3O00716 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F3O00716 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F3O00716 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F3O00716 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F3O00716 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F3O00716 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F3O00716 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F3O00716 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F3O00716 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F3O00716 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F3O00716 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F3O00716 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F3O00716 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F3O00716 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F3O00716 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F3O00716 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F3O00716 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2F3O00716 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F3O00716 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F3O00716 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F3O00716 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F3O00716 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F3O00716 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F3O00716 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2F3O00716 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F3O00716 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F3O00716 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F3O00716 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2F3O00716 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F3O00716 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F3O00716 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F3O00716 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F3O00716 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F3O00716 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2F3O00716 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F3O00716 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F3O00716 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F3O00716 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F3O00716 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F3O00716 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F3O00716 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F3O00716 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2F3O00716 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F3O00716 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F3O00716 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F3O00716 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F3O00716 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F3O00716 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F3O00716 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F3O00716 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F3O00716 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F3O00716 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F3O00716 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F3O00716 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F3O00716 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F3O00716 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F3O00716 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F3O00716 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F3O00716 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F3O00716 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F3O00716 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F3O00716 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F3O00716 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F3O00716 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F3O00716 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F3O00716 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F3O00716 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F3O00716 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F3O00716 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F3O00716 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F3O00716 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F3O00716 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F3O00716 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F3O00716 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F3O00716 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F3O00716 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F3O00716 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F3O00716 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms