Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2K7ER74 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms