Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP99D6REC4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP99D6REC4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP99D6REC4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms