Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAMB4A4D0S4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LAMB4A4D0S4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LAMB4A4D0S4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMB4A4D0S4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMB4A4D0S4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LAMB4A4D0S4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms