Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A087X0B3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A087X0B3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A087X0B3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms