Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms