Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HIGD2AQ9BW72 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms