Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEIL2Q969S2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms