Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF1Q3BBV0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms