Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR5A1Q13285 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NR5A1Q13285 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms