Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms