Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TFIP11Q9UBB9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFIP11Q9UBB9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms