Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SLC6A16Q9GZN6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC6A16Q9GZN6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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