Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms