Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APTXQ7Z2E3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms