Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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