Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms