Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms