Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG9BQ674R7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms