Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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RRN3P1Q2M238 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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