Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms