Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms