Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CTF1Q16619 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CTF1Q16619 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CTF1Q16619 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CTF1Q16619 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CTF1Q16619 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CTF1Q16619 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CTF1Q16619 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CTF1Q16619 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CTF1Q16619 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CTF1Q16619 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CTF1Q16619 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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