Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BPTFQ12830 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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