Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EP300Q09472 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EP300Q09472 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EP300Q09472 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EP300Q09472 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EP300Q09472 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EP300Q09472 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EP300Q09472 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EP300Q09472 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EP300Q09472 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EP300Q09472 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EP300Q09472 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms