Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms