Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CAPN3P20807 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAPN3P20807 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CAPN3P20807 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms