Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms