Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTA3Q9BTC8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms