Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HINFPQ9BQA5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms