Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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ATG16L1Q676U5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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ATG16L1Q676U5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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ATG16L1Q676U5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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ATG16L1Q676U5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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ATG16L1Q676U5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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ATG16L1Q676U5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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ATG16L1Q676U5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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ATG16L1Q676U5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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