Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms