Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms