Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms