Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 WDR31-201ENST00000341761 4862 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 IKZF4-202ENST00000431367 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PLEKHA6-205ENST00000637508 5704 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ALS2CL-201ENST00000318962 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ADAMTS4-202ENST00000367996 9773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 NRP1-208ENST00000395995 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
TMEM258P61165 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms