Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL4Q9C0H6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms