Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
HRCT1Q6UXD1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms