Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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