Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC1A5Q15758 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms