Protein–RNA interactions for Protein: Q15542

TAF5, Transcription initiation factor TFIID subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF5Q15542 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TAF5Q15542 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms