Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP290O15078 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP290O15078 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP290O15078 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP290O15078 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP290O15078 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP290O15078 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP290O15078 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP290O15078 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP290O15078 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CEP290O15078 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CEP290O15078 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms