Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CLCA4Q14CN2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CLCA4Q14CN2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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CLCA4Q14CN2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CLCA4Q14CN2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CLCA4Q14CN2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCA4Q14CN2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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