Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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IFT88Q13099 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFT88Q13099 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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