Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RPL39P62891 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RPL39P62891 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms