Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms